Nacido el 21 de junio de 1981 en Henderson, Nevada, Brandon Flowers es el menor de seis hermanos. Cuando tenía 5 años paso 3 años de su vida en Mérida, Yucatán. Su madre era ama de casa y su padre trabajaba en una tienda de abarrotes, además, es miembro de la Iglesia de Jesucristo de los Santos de los Últimos Días[cita requerida] a la cual Brandon se unió cuando tenía cinco años.
La persona que influenció a Flowers en su descubrimiento musical fue su hermano Shane, doce años mayor que él, con quien pudo conocer a varias bandas que serían la base para su posterior carrera musical como Smiths y The Shazzeman así como The Cars, The Beatles, Morrissey y The Cure.
La familia Flowers vivió en Henderson hasta que Brandon tuvo ocho años y se mudaron a Nephi, Utah, en donde el actual cantante de The Killers vivió hasta estudiar su tercer año de escuela secundaria en Juab High School para luego mudarse a Las Vegas con su tía.
Su amor por la música lo descubrió cuando de camino a su primer día de clase en la universidad, escuchó en la radio de su automóvil la canción "Heroes" de David Bowie. Fue entonces cuando decidió dedicarse al mundo de la música.